New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 15391 = | NA (NA) | 19 (0.070) | 16/172 | NT | 7.1% | intergenic (+93/‑54) | dnaJ/insL | chaperone Hsp40, co‑chaperone with DnaK/IS186/IS421 transposase |
? | NC_007779 | = 458023 | 261 (0.960) | intergenic (+99/‑89) | clpX/lon | ATPase and‑specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
Only 100 of 290 total aligned reads displayed.
CCCGCTAACCTCCCCAAAAGCCTGCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCA > NC_007779/15291‑15485 | ccGCTAACCTCCCCAAAAGCCTGCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGGGGGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCAt < 1:1385372/101‑1 (MQ=255) cGCTAACCTCCCCAAAAGCCTGCCCGTGGGTAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATa < 1:8015629/101‑1 (MQ=255) cGCTAACCTCCCCAAAAGCCTGCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTCAATCCCCTa > 1:13573868/1‑101 (MQ=255) cGCTAACCTCCCCAAAAGCCTGCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCAGTAAAGTGGCGGGGGTCACTCCCaca > 1:7649625/1‑99 (MQ=255) tAACCTCCCCAAAAGCCTGCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTCACCCCCCTaaac > 1:10053388/1‑99 (MQ=255) aaCCTCCCCAAAAGCCTGCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTCCCTCCCCTAAgcg > 1:13299708/1‑101 (MQ=255) cTCCCCAAAAGCCTGCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGACACTCCCCTAAGCGCTa > 1:7549803/1‑101 (MQ=255) ccccAAAAGCCTGCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTCACTCCCATAAACGCTAAc > 1:6258278/1‑101 (MQ=255) cccAAAAGCCTGCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTGAGTCCCACAAGCGCTAACt > 1:7391479/1‑101 (MQ=255) cccAAAAGCCTGCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACt < 1:445458/101‑1 (MQ=255) aaaaGCCTGCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTaa < 1:5280332/101‑1 (MQ=255) aaaaGCCTGCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTaa < 1:4838420/101‑1 (MQ=255) aGCCTGCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTTGCTCCCCGAAGCGCCTACTTAAggg > 1:11781336/1‑101 (MQ=255) aGCCTGCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTCACTCCCCTAAGCGCCAACTTAAggg > 1:12757853/1‑101 (MQ=255) ccTGCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGtt < 1:8139307/101‑1 (MQ=255) ccTGCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGtt < 1:5913303/101‑1 (MQ=255) cTGCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAACGCTAACTTAAGGGTtg > 1:5003679/1‑101 (MQ=255) tGCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgt < 1:4930489/101‑1 (MQ=255) gCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGGtgtg > 1:2670902/1‑101 (MQ=255) cGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTa < 1:10942897/101‑1 (MQ=255) gTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAt < 1:10779209/101‑1 (MQ=255) gTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAt < 1:5698313/101‑1 (MQ=255) gggCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTCACCCCCCTAAACGCCAACTTAAGGGGTGTGGTATTa > 1:8855923/1‑101 (MQ=255) cAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTCACTCCCATAAGAGCTCACTTAAGGGTTGTGGTATTAAGc > 1:2491156/1‑101 (MQ=38) aGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGGTGTGGGATTACGcc > 1:12443598/1‑101 (MQ=255) ggCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGGGGGGATCACCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCt < 1:3086202/101‑1 (MQ=255) ggCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTCACCCCCCAAAACCCTAACTTAAGGGGTGTGGGATTACGCCt > 1:3575925/1‑101 (MQ=255) gCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTCACTCCCATAAACGCTAACTTAAGGGTTGTGGGATTACGCCTg > 1:12148462/1‑101 (MQ=255) gCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTg < 1:11304334/101‑1 (MQ=255) ccTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTCACTCCCATAAACGCTAACTTAAGGGGTGTGGTATTTAGCCTGa > 1:6956846/1‑101 (MQ=255) cTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGat > 1:6076165/1‑101 (MQ=255) tGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGata < 1:3248206/101‑1 (MQ=255) ggTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATg < 1:3873403/101‑1 (MQ=255) ggTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGGTGTGGTATTACGCCTGGTATg > 1:9598773/1‑101 (MQ=255) aaaaaTAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAtt < 1:11651939/101‑1 (MQ=255) aaaaTAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAttt < 1:1772873/101‑1 (MQ=255) aaaaTAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCACTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAttt < 1:6577905/101‑1 (MQ=255) aaaTAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGGTGTGGTATTACGCCTGGTATGATTTa > 1:8271095/1‑101 (MQ=255) aaaTAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTa < 1:9174628/101‑1 (MQ=255) aaTAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCTCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTaa < 1:10333565/101‑1 (MQ=255) aaTAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGGTGTGGGATTACGCCTGATATGAtttta > 1:5245957/1‑99 (MQ=255) tAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACg < 1:169858/101‑1 (MQ=255) aGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGt < 1:8537093/101‑1 (MQ=255) gggTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTg < 1:10589969/101‑1 (MQ=255) ggTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGc < 1:13407571/101‑1 (MQ=255) tGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTCACTCCCCTAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGGATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCg > 1:6837086/1‑101 (MQ=255) tGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCg < 1:3595532/101‑1 (MQ=255) tGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCg < 1:6182041/101‑1 (MQ=255) gCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGa < 1:12258839/101‑1 (MQ=255) gTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATg < 1:6662343/101‑1 (MQ=255) ttGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTTGCTTCCATTATTGCGAACTTAAGGGTTGTGGGATTAACCCTGATAAGATTTAACTTGcccgcga > 1:12661432/1‑96 (MQ=255) tGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGGTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTTACGTGCCGATGaa > 1:10490431/1‑101 (MQ=255) tGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTCACCCCCCTAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGaa > 1:3150783/1‑101 (MQ=255) tGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGGCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGGTGTGGGATTACGCCTGATATGATTTTACGTGCCGGTGaa > 1:12697646/1‑101 (MQ=18) tGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGACAATCCCCTAAGGGCTAACTTTAAGGTTGTGGTATTACCCCTGATATGATTTAACGTGCCGAGGaa > 1:3747783/1‑101 (MQ=18) tGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCAAAAACGCCAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGAAGaa > 1:11155964/1‑101 (MQ=21) gAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGAGCACTCCCATAAGAGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCCGATATAATTTAACGTGCCGATGAAt > 1:2183709/1‑101 (MQ=18) aaGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGGCACTCCCCCAAGCGCCAACTTTAGGGTTGTGGGATTACGCCTGATATGATTTAACGGGCCGATGAAtt > 1:6695142/1‑101 (MQ=18) aGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTa < 1:13967583/101‑1 (MQ=255) gATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAc < 1:4272477/101‑1 (MQ=255) tatGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTActc < 1:11974800/101‑1 (MQ=255) atGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGGTGTGGGATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTActct > 1:7229236/1‑101 (MQ=255) gCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCCTAAGCGCCAACTTAAGGGGTGTGGGATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCa > 1:8330889/1‑101 (MQ=18) gCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGGTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAAGTGCCGATGAATTAAtctcc > 1:3001551/1‑100 (MQ=255) gAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGGTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACg > 1:10650090/1‑101 (MQ=255) gAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGGTCACTCCCATAAACGCTAACTTTAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTTACGTGGCGATGAATTACTCTCACg > 1:11093921/1‑101 (MQ=18) gAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGGGCTAACTTAAGGGTTGTGGGATTACGCCTGATATGATTTTACGTGCCGATGAAATACTCTCACg > 1:10215400/1‑101 (MQ=18) gAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACg < 1:2415237/101‑1 (MQ=255) gCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGAt < 1:4053975/101‑1 (MQ=255) gCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGAt < 1:13758915/101‑1 (MQ=255) cACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATa < 1:5607056/101‑1 (MQ=255) cACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATa < 1:7832624/101‑1 (MQ=255) aCCTGTAAAGTGGCGGGGGTCACTCCCATAAGGGCTAACTTAAGGGGTGTGGGATTACGCCTGATATGATTTAACGGGCCGATGAATTACTCTCACGATaa > 1:6871984/1‑101 (MQ=17) ccTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCCTAAGCGCTAACTTAAGGGGTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAAc > 1:5206927/1‑101 (MQ=255) ccTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAAc < 1:6764475/101‑1 (MQ=255) cTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACt < 1:1151224/101‑1 (MQ=255) 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1:13143925/101‑1 (MQ=35) gggATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCt < 1:11369792/101‑1 (MQ=35) ggATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTg < 1:4695521/101‑1 (MQ=35) ggATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTg < 1:12032278/101‑1 (MQ=35) ggATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTg < 1:14046067/101‑1 (MQ=35) aTCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGc < 1:8948480/101‑1 (MQ=34) cACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGccc < 1:12905117/101‑1 (MQ=32) cACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGccc > 1:2005950/1‑101 (MQ=32) cACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGccc > 1:652648/1‑101 (MQ=32) aCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCa < 1:2156194/101‑1 (MQ=31) | CCCGCTAACCTCCCCAAAAGCCTGCCCGTGGGCAGGCCTGGGTAAAAATAGGGTGCGTTGAAGATATGCGAGCACCTGTAAAGTGGCGGGGATCACTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCA > NC_007779/15291‑15485 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |