| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_007779 | 3,958,123 | Δ34 bp | 100% | coding (1156‑1189/1287 nt) | dctA → | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_007779 | 3958123 | 3958156 | 34 | 236 [0] | [0] 237 | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 3958122 | 0 (0.000) | 201 (1.030) | 116/176 | NT | 100% | coding (1155/1287 nt) | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
| ? | NC_007779 | 3958157 = | 0 (0.000) | coding (1190/1287 nt) | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter | |||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
TCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGACTAACCTGGTCGGTAACGGCGTAGCGACCATTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGC > NC_007779/3958022‑3958222 | cGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGt > 1:7010727‑M1/1‑100 (MQ=255) gTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtc < 1:9785254‑M1/101‑3 (MQ=255) gCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgt > 1:8348980‑M1/1‑97 (MQ=255) gCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgt < 1:620005‑M1/101‑5 (MQ=255) gCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgt > 1:5510817‑M1/1‑97 (MQ=255) cTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgtt > 1:2159326‑M1/1‑96 (MQ=255) cTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTACCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgtt > 1:5694869‑M1/1‑96 (MQ=255) tGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttg > 1:1268794‑M1/1‑95 (MQ=255) ggcggcGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgc < 1:2577518‑M1/101‑8 (MQ=255) cggcgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgcta < 1:3059401‑M1/101‑10 (MQ=255) ggcgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaa > 1:9937704‑M1/1‑91 (MQ=255) ggcgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaa > 1:3992017‑M1/1‑91 (MQ=255) gcgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaag > 1:4633340‑M1/1‑90 (MQ=255) cgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagt < 1:7886833‑M1/101‑13 (MQ=255) gACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtg > 1:288655‑M1/1‑88 (MQ=255) aCGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgg < 1:2291086‑M1/101‑15 (MQ=255) aCGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgg < 1:6698685‑M1/101‑15 (MQ=255) aCGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgg < 1:9686188‑M1/101‑15 (MQ=255) cGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtggg > 1:7495069‑M1/1‑86 (MQ=255) gCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggt < 1:5072649‑M1/101‑17 (MQ=255) gCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggt > 1:3502537‑M1/1‑85 (MQ=255) gCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggg > 1:6005218‑M1/1‑85 (MQ=255) tctctGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtga > 1:2497314‑M1/1‑83 (MQ=255) ctGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACGGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaag > 1:6044522‑M1/1‑80 (MQ=255) ctGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGGCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaag < 1:2882925‑M1/101‑22 (MQ=255) gCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaa > 1:7623455‑M1/1‑78 (MQ=255) cGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaac < 1:4576161‑M1/101‑25 (MQ=255) ggTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaact > 1:7293185‑M1/1‑76 (MQ=255) gTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactg < 1:9261284‑M1/101‑27 (MQ=255) tGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactgg < 1:4034576‑M1/101‑28 (MQ=255) gggCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactgga > 1:9913743‑M1/1‑73 (MQ=255) ttGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaa > 1:9219133‑M1/1‑66 (MQ=255) gCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaa < 1:8051156‑M1/101‑38 (MQ=255) gCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaa < 1:8599459‑M1/101‑38 (MQ=255) ccGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaa > 1:7051785‑M1/1‑63 (MQ=255) ccGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaa < 1:8466395‑M1/101‑39 (MQ=255) cGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaac > 1:739646‑M1/1‑62 (MQ=255) ggTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaact < 1:7241596‑M1/101‑41 (MQ=255) ggTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaact < 1:518676‑M1/101‑41 (MQ=255) tAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactgg < 1:3679573‑M1/101‑43 (MQ=255) aGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactgga < 1:4402338‑M1/101‑44 (MQ=255) gCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggac < 1:1577837‑M1/101‑45 (MQ=255) cGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacg < 1:3911537‑M1/101‑46 (MQ=255) gggTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactgaccacaaaaaactggacgat > 1:8727591‑M1/1‑55 (MQ=255) gTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatg > 1:1072777‑M1/1‑53 (MQ=255) gTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatg < 1:4747518‑M1/101‑49 (MQ=255) tCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgt < 1:5582616‑M1/101‑50 (MQ=255) cTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtg < 1:3284812‑M1/101‑51 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |