Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
MC JC | NC_007779 | 3,958,123 | Δ34 bp | 100% | coding (1156‑1189/1287 nt) | dctA → | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_007779 | 3958123 | 3958156 | 34 | 236 [0] | [0] 237 | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 3958122 | 0 (0.000) | 201 (1.030) | 116/176 | NT | 100% | coding (1155/1287 nt) | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
? | NC_007779 | 3958157 = | 0 (0.000) | coding (1190/1287 nt) | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
TGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGACTAACCTGGTCGGTAACGGCGTAGCGACCATTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCT > NC_007779/3958058‑3958257 | gtgctggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTc < 1:9785254‑M2/2‑1 (MQ=255) gtgctggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTc > 1:2600069‑M2/100‑101 (MQ=255) ctggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGtt < 1:6428757‑M2/5‑1 (MQ=255) ctggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGtt < 1:4417648‑M2/5‑1 (MQ=255) tggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCgttc > 1:1990298‑M2/96‑100 (MQ=255) tggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTg > 1:1268794‑M2/96‑101 (MQ=255) cggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTa > 1:4172723‑M2/93‑101 (MQ=255) cggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTa < 1:6193037‑M2/9‑1 (MQ=255) ggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggtgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTaa < 1:8716367‑M2/10‑1 (MQ=255) ggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTaa > 1:8750209‑M2/92‑101 (MQ=255) ggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTaa < 1:4642385‑M2/10‑1 (MQ=255) ggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTaa < 1:7397047‑M2/10‑1 (MQ=255) ggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTaa > 1:9937704‑M2/92‑101 (MQ=255) gcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAg > 1:8469014‑M2/91‑101 (MQ=255) gacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTg < 1:8204254‑M2/13‑1 (MQ=255) gacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTg > 1:288655‑M2/89‑101 (MQ=255) acgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTgg < 1:2291086‑M2/14‑1 (MQ=255) acgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTgg < 1:9686188‑M2/14‑1 (MQ=255) acgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTgg < 1:728220‑M2/14‑1 (MQ=255) gctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGt < 1:5659882‑M2/16‑1 (MQ=255) gctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGt > 1:6023103‑M2/86‑101 (MQ=255) tctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGa > 1:8645168‑M2/84‑101 (MQ=255) tctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGaaa < 1:787228‑M2/20‑1 (MQ=255) tctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGaaa > 1:1889414‑M2/82‑101 (MQ=255) ctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAg < 1:5324606‑M2/21‑1 (MQ=255) ggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACt < 1:723318‑M2/25‑1 (MQ=255) gtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgttcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTg > 1:653012‑M2/76‑101 (MQ=255) gtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTg > 1:4393004‑M2/76‑101 (MQ=255) gggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGa > 1:9913743‑M2/74‑101 (MQ=255) ggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGAc < 1:16986‑M2/29‑1 (MQ=255) ggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGAc < 1:5456433‑M2/29‑1 (MQ=255) ggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGAc < 1:4761514‑M2/29‑1 (MQ=255) gccatttgccggtagcgggtcgggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGAcc > 1:9248158‑M2/72‑101 (MQ=255) atttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACcaca < 1:2459520‑M2/33‑1 (MQ=255) ttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACaaa > 1:2338467‑M2/67‑101 (MQ=255) cggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAAc > 1:7438463‑M2/63‑101 (MQ=255) gtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTg > 1:6962231‑M2/61‑101 (MQ=255) tagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTgg < 1:3679573‑M2/42‑1 (MQ=255) tagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTgg < 1:9056584‑M2/42‑1 (MQ=255) gcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGAc < 1:3447736‑M2/44‑1 (MQ=255) cgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACg < 1:3911537‑M2/45‑1 (MQ=255) ggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGAt > 1:732486‑M2/55‑101 (MQ=255) gtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGAtg > 1:1072777‑M2/54‑101 (MQ=255) gtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGAtg > 1:8914128‑M2/54‑101 (MQ=255) gtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGAtg < 1:6284617‑M2/48‑1 (MQ=255) ctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGAtgtg < 1:3284812‑M2/50‑1 (MQ=255) tggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGc < 1:7533929‑M2/51‑1 (MQ=255) tggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGc < 1:9443335‑M2/51‑1 (MQ=255) tggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGc > 1:4817788‑M2/51‑101 (MQ=255) gcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTg < 1:8356822‑M2/53‑1 (MQ=255) cgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGa < 1:668941‑M2/54‑1 (MQ=255) ctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGaat < 1:9552536‑M2/56‑1 (MQ=255) tgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGaata > 1:7626696‑M2/45‑101 (MQ=255) gatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGaataa < 1:3112970‑M2/58‑1 (MQ=255) atcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGaataat > 1:4246890‑M2/43‑101 (MQ=255) atcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGaataat > 1:8419111‑M2/43‑101 (MQ=255) tcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATc < 1:1716610‑M2/60‑1 (MQ=255) tcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATc > 1:5012980‑M2/42‑101 (MQ=255) cctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCg < 1:3027309‑M2/61‑1 (MQ=255) cctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCg < 1:1381617‑M2/61‑1 (MQ=255) cctcggtatcgaccgctatatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCg < 1:2360629‑M2/61‑1 (MQ=255) ctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGt > 1:612564‑M2/40‑101 (MQ=255) tcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTg > 1:4009525‑M2/39‑101 (MQ=255) cggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTgc < 1:6241731‑M2/64‑1 (MQ=255) ggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTgcg > 1:6090522‑M2/37‑101 (MQ=255) ggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTgcg > 1:5765784‑M2/37‑101 (MQ=255) atcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCg < 1:9819790‑M2/68‑1 (MQ=255) atcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCg < 1:2863390‑M2/68‑1 (MQ=255) tcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCgg < 1:7834603‑M2/69‑1 (MQ=255) cgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGa > 1:3725099‑M2/32‑101 (MQ=255) gaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGAt > 1:6778562‑M2/31‑101 (MQ=255) accgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATg > 1:7013105‑M2/30‑101 (MQ=255) accgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATg > 1:3316142‑M2/30‑101 (MQ=255) accgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATg < 1:5080610‑M2/72‑1 (MQ=255) cgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGc < 1:1016656‑M2/74‑1 (MQ=255) tttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCaaa < 1:1119095‑M2/77‑1 (MQ=255) ttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCaaaa < 1:251655‑M2/78‑1 (MQ=255) tatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGTTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAAc < 1:5894610‑M2/79‑1 (MQ=255) tgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGc < 1:3865957‑M2/81‑1 (MQ=255) agaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGa < 1:9146777‑M2/85‑1 (MQ=255) gaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGaa > 1:2793563‑M2/16‑101 (MQ=255) aagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAAt < 1:8124831‑M2/87‑1 (MQ=255) agctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAAtt < 1:4622065‑M2/88‑1 (MQ=255) gctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTa > 1:4860564‑M2/13‑101 (MQ=255) gctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTa > 1:4521278‑M2/13‑101 (MQ=255) tcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATc > 1:2143186‑M2/11‑101 (MQ=255) gtgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCct > 1:7089592‑M2/9‑101 (MQ=255) tgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCctc < 1:8570853‑M2/94‑1 (MQ=255) tgcgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCctc > 1:5560759‑M2/8‑101 (MQ=255) cgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCtt < 1:5146012‑M2/96‑1 (MQ=255) cgctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCtt < 1:5742213‑M2/96‑1 (MQ=255) gctgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTa > 1:8140810‑M2/5‑101 (MQ=255) tgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAAt > 1:9306086‑M2/3‑101 (MQ=255) tgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAAt > 1:7897001‑M2/3‑101 (MQ=255) tgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAAt > 1:9538116‑M2/3‑101 (MQ=255) tgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAAt > 1:5223205‑M2/3‑101 (MQ=255) tgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAAt < 1:7595904‑M2/99‑1 (MQ=255) gTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATc > 1:9731720‑M2/2‑101 (MQ=255) tCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAAtct < 1:3590766/101‑1 (MQ=255) tCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAAtct < 1:157589/101‑1 (MQ=255) | TGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGACTAACCTGGTCGGTAACGGCGTAGCGACCATTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCT > NC_007779/3958058‑3958257 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |