| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_007779 | 3,958,123 | Δ34 bp | 100% | coding (1156‑1189/1287 nt) | dctA → | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_007779 | 3958123 | 3958156 | 34 | 317 [0] | [0] 316 | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 3958122 | 0 (0.000) | 268 (0.930) | 125/176 | NT | 100% | coding (1155/1287 nt) | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
| ? | NC_007779 | 3958157 = | 0 (0.000) | coding (1190/1287 nt) | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter | |||||
Only 100 of 317 total aligned reads displayed.
TCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGACTAACCTGGTCGGTAACGGCGTAGCGACCATTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGC > NC_007779/3958022‑3958222 | tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTG > 1:8103664‑M1/1‑101 (MQ=255) cGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGt > 1:9894754‑M1/1‑100 (MQ=255) cGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGt > 1:6006639‑M1/1‑100 (MQ=255) cGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGt < 1:11046970‑M1/101‑2 (MQ=255) gTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtc < 1:613714‑M1/101‑3 (MQ=255) gTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtc < 1:6465636‑M1/101‑3 (MQ=255) ggcggcGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgc > 1:13773438‑M1/1‑94 (MQ=255) ggcggcGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgc < 1:12488231‑M1/101‑8 (MQ=255) gcggcgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgct < 1:52825‑M1/101‑9 (MQ=255) cggcgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgcta < 1:12365677‑M1/101‑10 (MQ=255) ggctACGCTCTCTGCTGTGGGCCATTTGCCCGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCTGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTgtcgttgctaa < 1:269176/101‑11 (MQ=255) ggcgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaa < 1:5722361‑M1/101‑11 (MQ=255) ggcgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaa > 1:5299520‑M1/1‑91 (MQ=255) gcgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaag < 1:8371715‑M1/101‑12 (MQ=255) gcgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaag < 1:941505‑M1/101‑12 (MQ=255) gcgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaag < 1:3234272‑M1/101‑12 (MQ=255) cgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagt > 1:9749730‑M1/1‑89 (MQ=255) gACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtg > 1:7592025‑M1/1‑88 (MQ=255) gACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtg < 1:6364477‑M1/101‑14 (MQ=255) gACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtg > 1:1065120‑M1/1‑88 (MQ=255) gACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtg > 1:14963950‑M1/1‑88 (MQ=255) aCGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTAACGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgg < 1:11555696‑M1/101‑15 (MQ=255) cGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtggg < 1:9210023‑M1/101‑16 (MQ=255) cGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtggg < 1:10499459‑M1/101‑16 (MQ=255) gCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggt > 1:1007403‑M1/1‑85 (MQ=255) ctctctGCGGTGGGACATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagggggtg > 1:4064385‑M1/1‑84 (MQ=255) tctctGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtga > 1:2485969‑M1/1‑83 (MQ=255) ctctGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGGCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaa > 1:3558084‑M1/1‑82 (MQ=255) ctGCGGTGGGCTATTTGCCGGTAGCAGGTCTGGCGGTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaag < 1:2178360‑M1/101‑22 (MQ=255) ctGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaag > 1:5449978‑M1/1‑80 (MQ=255) ctGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaag < 1:13517883‑M1/101‑22 (MQ=255) tGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaaga < 1:1757335‑M1/101‑23 (MQ=255) ggTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaact > 1:12163105‑M1/1‑76 (MQ=255) ggtggcaaTTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCGGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactg < 1:1659305‑M1/98‑27 (MQ=255) gTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactg > 1:12823776‑M1/1‑75 (MQ=255) tGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactgg < 1:4338506‑M1/101‑28 (MQ=255) tGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactgg < 1:7272960‑M1/101‑28 (MQ=255) ggCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggac > 1:4771647‑M1/1‑72 (MQ=255) ggCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggac < 1:1819610‑M1/101‑30 (MQ=255) ggCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggac < 1:116315‑M1/101‑30 (MQ=255) cATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccac > 1:12597965‑M1/1‑69 (MQ=255) aTTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccaca > 1:7464998‑M1/1‑68 (MQ=255) tttGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaa > 1:9639322‑M1/1‑67 (MQ=255) ttGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaa < 1:3394732‑M1/101‑36 (MQ=255) ccGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaa < 1:7672028‑M1/101‑39 (MQ=255) gTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactg < 1:11939216‑M1/101‑42 (MQ=255) gTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactg > 1:2162925‑M1/1‑60 (MQ=255) tAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactgg > 1:14381179‑M1/1‑59 (MQ=255) 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tttATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaa > 1:13650363‑M1/1‑24 (MQ=255) tttATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaa < 1:5882193‑M1/101‑78 (MQ=255) tttATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaa < 1:4984274‑M1/101‑78 (MQ=255) ttATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaa < 1:5588261‑M1/101‑79 (MQ=255) tATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaac < 1:7978898‑M1/101‑80 (MQ=255) tATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaac < 1:14735967‑M1/101‑80 (MQ=255) tATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaac < 1:13223739‑M1/101‑80 (MQ=255) 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cTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaattatcctcttaa < 1:14138847‑M1/101‑99 (MQ=255) tGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaattatcctcttaat > 1:13061091‑M1/1‑2 (MQ=255) gtcgttgccaagtgggtgaaagaactggcccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgggcgccggatggcaaaacgcacgaattatcctcttaatc < 1:11258941‑M1/101‑101 (MQ=255) | TCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGACTAACCTGGTCGGTAACGGCGTAGCGACCATTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGC > NC_007779/3958022‑3958222 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |