| Predicted mutation | |||||||
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| MC JC | NC_007779 | 3,958,123 | Δ34 bp | 100% | coding (1156‑1189/1287 nt) | dctA → | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_007779 | = 3958122 | 0 (0.000) | 268 (0.930) | 125/176 | NT | 100% | coding (1155/1287 nt) | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
| ? | NC_007779 | 3958157 = | 0 (0.000) | coding (1190/1287 nt) | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter | |||||
Only 100 of 316 total aligned reads displayed.
TTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGACTAACCTGGTCGGTAACGGCGTAGCGACCATTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCT > NC_007779/3958057‑3958257 | cgtgctggcggcgacgctctctgcggtggtccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgt < 1:4068862‑M2/1‑1 (MQ=255)cgtgctggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgt > 1:9894754‑M2/101‑101 (MQ=255) gtgctggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatccttggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTc < 1:413323‑M2/2‑1 (MQ=255) gtgctggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTc < 1:12843039‑M2/2‑1 (MQ=255) ctggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGtt < 1:1570029‑M2/5‑1 (MQ=255) ctggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGtt < 1:6740226‑M2/5‑1 (MQ=255) ctggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtccgctgTCGtt > 1:2801011‑M2/97‑101 (MQ=255) tggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTg > 1:4644344‑M2/96‑101 (MQ=255) tggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTg < 1:14777718‑M2/6‑1 (MQ=255) ggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGc > 1:13127432‑M2/95‑101 (MQ=255) gcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCt < 1:6031951‑M2/8‑1 (MQ=255) gcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcggggctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCt < 1:14044501‑M2/8‑1 (MQ=255) cggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTa < 1:2678533‑M2/9‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |