| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_007779 | 3,958,123 | Δ34 bp | 100% | coding (1156‑1189/1287 nt) | dctA → | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_007779 | 3958123 | 3958156 | 34 | 322 [0] | [0] 322 | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 3958122 | 0 (0.000) | 269 (0.960) | 140/176 | NT | 100% | coding (1155/1287 nt) | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
| ? | NC_007779 | 3958157 = | 0 (0.000) | coding (1190/1287 nt) | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter | |||||
Only 100 of 322 total aligned reads displayed.
TCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGACTAACCTGGTCGGTAACGGCGTAGCGACCATTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCG > NC_007779/3958022‑3958221 | tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTG > 1:1997684‑M1/1‑101 (MQ=255)tCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTG < 1:550243‑M1/101‑1 (MQ=255) cGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGt > 1:2506899‑M1/1‑100 (MQ=255) cGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGt > 1:12244577‑M1/1‑100 (MQ=255) cGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGt > 1:5331811‑M1/1‑100 (MQ=255) gTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtc < 1:14058508‑M1/101‑3 (MQ=255) gTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtc < 1:13250077‑M1/101‑3 (MQ=255) tGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcg > 1:14516783‑M1/1‑98 (MQ=255) gcggcgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgct < 1:7652882‑M1/101‑9 (MQ=255) ggcgGCCCTCGCGGCGGTGGGCCATGTGCCGGTGGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCCCCCTTTTTAGGGCAGAAGCTCGTGCGCTgtcgttgctaa < 1:10638998/101‑11 (MQ=255) ggcgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGGGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaa > 1:837993‑M1/1‑91 (MQ=255) ggcgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaa > 1:3265556‑M1/1‑91 (MQ=255) gcgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaag > 1:11720384‑M1/1‑90 (MQ=255) aCGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgg < 1:1967558‑M1/101‑15 (MQ=255) aCGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgg < 1:8127074‑M1/101‑15 (MQ=255) cGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtggg < 1:10324452‑M1/101‑16 (MQ=255) cGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtggg < 1:12344826‑M1/101‑16 (MQ=255) gCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggt < 1:2811089‑M1/101‑17 (MQ=255) ctctGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaa > 1:6684144‑M1/1‑82 (MQ=255) tctGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaa < 1:6075170‑M1/101‑21 (MQ=255) tGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaaga < 1:2764458‑M1/101‑23 (MQ=255) tGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaaga > 1:9830051‑M1/1‑79 (MQ=255) gTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactg > 1:6909821‑M1/1‑75 (MQ=255) tGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactgg > 1:368878‑M1/1‑74 (MQ=255) tGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactgg > 1:6597370‑M1/1‑74 (MQ=255) tGGGACATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactgg > 1:13326432‑M1/1‑74 (MQ=255) ggCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggac > 1:14591339‑M1/1‑72 (MQ=255) ccATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggacca > 1:4342279‑M1/1‑70 (MQ=255) aTTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccaca < 1:7491355‑M1/101‑34 (MQ=255) ttGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaa < 1:11458608‑M1/101‑36 (MQ=255) gCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaa < 1:8814622‑M1/101‑38 (MQ=255) gCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaa < 1:10119590‑M1/101‑38 (MQ=255) ccGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaa > 1:5385824‑M1/1‑63 (MQ=255) ccGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaa < 1:8018564‑M1/101‑39 (MQ=255) gTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactg < 1:12527068‑M1/101‑42 (MQ=255) tAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactgg < 1:12275749‑M1/101‑43 (MQ=255) aGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTTtcgttgctaagtgggtgaaagaaatggaccacaaaaaactgga > 1:6345740‑M1/1‑58 (MQ=255) aGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactgga > 1:2059748‑M1/1‑58 (MQ=255) cGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacg < 1:2260325‑M1/101‑46 (MQ=255) gggTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacga > 1:11923579‑M1/1‑55 (MQ=255) tCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgt < 1:14450250‑M1/101‑50 (MQ=255) tCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgt < 1:10704211‑M1/101‑50 (MQ=255) tCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgt < 1:8319353‑M1/101‑50 (MQ=255) cTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtg < 1:6757563‑M1/101‑51 (MQ=255) cTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtg < 1:13553122‑M1/101‑51 (MQ=255) cgcTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctga < 1:13893031‑M1/101‑55 (MQ=255) gcTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaa < 1:5104808‑M1/101‑56 (MQ=255) tGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaata < 1:7526513‑M1/101‑58 (MQ=255) 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cTGgcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccgcatggcaaaacgcacgaattagcctcttaa < 1:9437960‑M1/101‑99 (MQ=255) tGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaattatcctcttaat > 1:7237002‑M1/1‑2 (MQ=255) tGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggacacaaaaaactggacggtgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaattatcctcttaatc > 1:14382873‑M1/1‑2 (MQ=255) | TCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGACTAACCTGGTCGGTAACGGCGTAGCGACCATTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCG > NC_007779/3958022‑3958221 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |