| Predicted mutation | |||||||
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| MC JC | NC_007779 | 3,958,123 | Δ34 bp | 100% | coding (1156‑1189/1287 nt) | dctA → | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_007779 | = 3958122 | 0 (0.000) | 269 (0.960) | 140/176 | NT | 100% | coding (1155/1287 nt) | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
| ? | NC_007779 | 3958157 = | 0 (0.000) | coding (1190/1287 nt) | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter | |||||
Only 100 of 322 total aligned reads displayed.
TTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGACTAACCTGGTCGGTAACGGCGTAGCGACCATTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATCT > NC_007779/3958057‑3958257 | cgtgctggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgt > 1:11148864‑M2/101‑101 (MQ=255) gctggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGt > 1:10641175‑M2/98‑101 (MQ=255) gctggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGt > 1:5497448‑M2/98‑101 (MQ=255) tggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTg > 1:12246767‑M2/96‑101 (MQ=255) ggcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGc < 1:13866038‑M2/7‑1 (MQ=255) gcggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCt < 1:7652882‑M2/8‑1 (MQ=255) ggcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggggctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTaa > 1:837993‑M2/92‑101 (MQ=255) gcgacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAg < 1:3688397‑M2/11‑1 (MQ=255) gacgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTg < 1:11818775‑M2/13‑1 (MQ=255) acgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTgg < 1:8127074‑M2/14‑1 (MQ=255) cgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTggg < 1:12344826‑M2/15‑1 (MQ=255) cgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTggg < 1:10324452‑M2/15‑1 (MQ=255) cgctctctgcggtgggccatttgccggtagcgggtctggcgctgatcctcggtatcgaccgctttatgtcagaagctcgtgcgctgTCGTTGCTAAGTggg < 1:1323181‑M2/15‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |