| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 2320794 = | NA (NA) | 357 (1.020) | 126/180 | NT | 100% | intergenic (+633/+11) | rcsB/insD | DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with RcsC and YojN/IS2 element protein |
| ? | NC_007779 | = 2589834 | 0 (0.000) | intergenic (+470/‑69) | acrD/yffB | aminoglycoside/multidrug efflux system/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 378 total aligned reads displayed.
GTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/2320881‑2320794‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCATCTTGTTAT < NC_007779/2589834‑2589735 TATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAA‑TATCAGGAAATATA > 1:5690036/1‑101 ATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATA < 1:3416661/101‑1 ATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATA < 1:4916317/101‑1 ATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATA > 1:14777949/1‑101 CGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAAC < 1:16716270/101‑1 GCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACA > 1:15168903/1‑101 GCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACA < 1:15075018/101‑1 GCTCGCCACGGGAACATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACA < 1:16547442/101‑1 CGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGGAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTA > 1:12928047/1‑101 CGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTA < 1:6077158/101‑1 CACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCG > 1:17295487/1‑101 CACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCG > 1:15392565/1‑101 CACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCG > 1:4725283/1‑101 CGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAA < 1:2912687/101‑1 CGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAA < 1:8807607/101‑1 CGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAA < 1:11968132/101‑1 GGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAG > 1:8403233/1‑101 GGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAG < 1:2041179/101‑1 GGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGT < 1:5883184/101‑1 GAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTA < 1:3916625/101‑1 AATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTAT > 1:13402908/1‑101 ATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATT < 1:646249/101‑1 ATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCA > 1:6329867/1‑101 ATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCA < 1:8683812/101‑1 TCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAA > 1:10072302/1‑101 TGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAAT < 1:2653357/101‑1 GCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATT < 1:10229120/101‑1 CGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTA < 1:4581477/101‑1 GGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAA < 1:7014912/101‑1 AGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAA > 1:16927692/1‑101 CGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACT < 1:9392584/101‑1 CGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACT < 1:2822628/101‑1 GGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTAT > 1:13942349/1‑101 GGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACACATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTAT < 1:9005807/101‑1 GCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATT > 1:8314150/1‑101 GCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATT < 1:3003887/101‑1 CTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATGAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTA > 1:11622687/1‑101 CTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTA < 1:11011570/101‑1 TGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAA < 1:8064661/101‑1 TGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAA < 1:1577954/101‑1 GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAAT < 1:2163634/101‑1 GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAAT < 1:3524704/101‑1 TAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAAAAACTATTAAAaa > 1:16080576/1‑99 TGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATA > 1:16224458/1‑101 GGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAGTAT < 1:8474708/101‑1 GGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATAT < 1:3182225/101‑1 GGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATAT > 1:1230749/1‑101 GGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATT < 1:236585/101‑1 GGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATT < 1:16445494/101‑1 GGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATT < 1:4357442/101‑1 GGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATT < 1:6626993/101‑1 TTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAA < 1:1790949/101‑1 TTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAA < 1:11793959/101‑1 TTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAA < 1:1383399/101‑1 TAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAA < 1:9823675/101‑1 TAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAA < 1:10371843/101‑1 TAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAA < 1:1963231/101‑1 AAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAAC < 1:1704237/101‑1 AAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAAC < 1:10479721/101‑1 TGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATT < 1:12573111/101‑1 TGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATT > 1:14520348/1‑101 TGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATT < 1:12024110/101‑1 ATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTT > 1:8145310/1‑101 TAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAATTAATATTAAACATTTTT > 1:15905608/1‑101 TAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTT < 1:11293277/101‑1 AACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTga > 1:12782676/1‑99 AACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTA < 1:15251443/101‑1 ACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAA < 1:1754765/101‑1 CAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAAC > 1:5378307/1‑101 AGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACG < 1:17404417/101‑1 AGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACG < 1:12166487/101‑1 GATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGT < 1:9739147/101‑1 GATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGT < 1:2681795/101‑1 TGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAA < 1:7493012/101‑1 GTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAA < 1:368846/101‑1 GTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAA < 1:15537536/101‑1 CTGGAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACA < 1:5153141/101‑1 CTGGAAATATAGGGGCAAATCCAAGAATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACA < 1:13556059/101‑1 GAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTA < 1:2429360/101‑1 GAAATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTA < 1:7396794/101‑1 AATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAG < 1:16385726/101‑1 AATATAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAG < 1:7530161/101‑1 TAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATA > 1:10719907/1‑101 TAGGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATA > 1:1189527/1‑101 GGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATT < 1:11535515/101‑1 GGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATT > 1:4430523/1‑101 GGGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATT < 1:1902636/101‑1 GGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTC < 1:11125889/101‑1 GGGCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTC < 1:11417682/101‑1 GCAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCAT < 1:7249982/101‑1 CAAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTTACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCATC > 1:13797028/1‑101 AAATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCATCT > 1:1470046/1‑101 AATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCATCTT > 1:16798163/1‑101 AATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCATCTT > 1:14217944/1‑101 AATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCATCTT < 1:6940812/101‑1 AATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCATCTT < 1:9067599/101‑1 ATCCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCATCTTG < 1:6768579/101‑1 CCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCATCTTGTT > 1:1172553/1‑101 CCAATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCATCTTGTT < 1:4199499/101‑1 AATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCATCTTGTTAT > 1:5195317/1‑101 GTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/2320881‑2320794‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTATCAGGAAATATAACATTATCGAAGTATTCAAATTAACAACTATTAAATAATATTAAACATTTTTAACGTAAACATTAAGAATATTCATCTTGTTAT < NC_007779/2589834‑2589735 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |