| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_007779 | 1,301,041 | Δ1,336 bp | 100% | insC–insD | insC, insD | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_007779 | 1301041–1302367 | 1302376 | 10–1336 | 227 [1] | [0] 226 | insC–insD | insC, insD |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 1301040 | 1 (0.000) | 184 (0.850) | 104/166 | NT | 99.8% | intergenic (+218/‑90) | ychE/insC | inner membrane protein/IS2 element protein |
| ? | NC_007779 | 1302377 = | 0 (0.000) | intergenic (+19/‑519) | insD/oppA | IS2 element protein/oligopeptide transporter subunit | |||||
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
AGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGT > NC_007779/1300940‑1301140 | agttagttATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTA > 1:5331340‑M1/1‑101 (MQ=255) gttagttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAt < 1:9313947‑M1/101‑2 (MQ=255) gttagttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAt > 1:8300304‑M1/1‑100 (MQ=255) gttagttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAt > 1:1934336‑M1/1‑100 (MQ=255) ttagttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAtt > 1:7748977‑M1/1‑99 (MQ=255) ttagttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAtt < 1:5585192‑M1/101‑3 (MQ=255) tagttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAtta > 1:3260069‑M1/1‑98 (MQ=255) tagttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAtta < 1:10950490‑M1/101‑4 (MQ=255) gttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaat < 1:6879189‑M1/101‑6 (MQ=255) ttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaatt < 1:7095833‑M1/101‑7 (MQ=255) ttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaatt < 1:4023132‑M1/101‑7 (MQ=255) aaGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccac < 1:4837976‑M1/101‑11 (MQ=255) gATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgc > 1:11283458‑M1/1‑88 (MQ=255) ttCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctt > 1:4242558‑M1/1‑85 (MQ=255) ttCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctt > 1:5290924‑M1/1‑85 (MQ=255) tCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgccttt > 1:4633700‑M1/1‑84 (MQ=255) tCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgccttt < 1:8093551‑M1/101‑18 (MQ=255) tCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgccttt < 1:1763597‑M1/101‑18 (MQ=255) ccTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttg > 1:6356168‑M1/1‑83 (MQ=255) cTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttgg < 1:6202413‑M1/101‑20 (MQ=255) cTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttgg > 1:10578369‑M1/1‑82 (MQ=255) ttAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggt < 1:4205676‑M1/101‑21 (MQ=255) ttAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggt > 1:1024159‑M1/1‑81 (MQ=255) tAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggta < 1:5807993‑M1/101‑22 (MQ=255) tAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggta > 1:25468‑M1/1‑80 (MQ=255) aaCTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtag > 1:1898239‑M1/1‑79 (MQ=255) aaCTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtag > 1:10013804‑M1/1‑79 (MQ=255) aCTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtaga < 1:2067128‑M1/101‑24 (MQ=255) cTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagag < 1:1615172‑M1/101‑25 (MQ=255) cTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagag > 1:72571‑M1/1‑77 (MQ=255) cTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagag > 1:6166313‑M1/1‑77 (MQ=255) tGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagagg < 1:10800261‑M1/101‑26 (MQ=255) ttCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaa < 1:8448574‑M1/101‑29 (MQ=255) ttCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaa > 1:8008385‑M1/1‑73 (MQ=255) tctcCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaag > 1:3040501‑M1/1‑72 (MQ=255) tcctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtg < 1:2246793‑M1/101‑32 (MQ=255) ctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgct < 1:1550776‑M1/101‑34 (MQ=255) ctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgct > 1:2923823‑M1/1‑68 (MQ=255) tcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgcta < 1:10084590‑M1/101‑35 (MQ=255) cACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaa < 1:9692419‑M1/101‑36 (MQ=255) cACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaa < 1:3540030‑M1/101‑36 (MQ=255) aCCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa < 1:551696‑M1/101‑37 (MQ=255) aCCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa < 1:1048603‑M1/101‑37 (MQ=255) ccATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat < 1:1159332‑M1/101‑38 (MQ=255) atcatGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa > 1:8910337‑M1/1‑62 (MQ=255) atcatGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa > 1:6466708‑M1/1‑62 (MQ=255) atcatGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa < 1:2181419‑M1/101‑40 (MQ=255) atGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa < 1:3438279‑M1/101‑43 (MQ=255) atGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa > 1:744876‑M1/1‑59 (MQ=255) atGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa < 1:3632025‑M1/101‑43 (MQ=255) atGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa > 1:11527646‑M1/1‑59 (MQ=255) aTTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaat > 1:10669535‑M1/1‑54 (MQ=255) ttttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaatt > 1:11035336‑M1/1‑53 (MQ=255) tttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattg < 1:8619125‑M1/101‑50 (MQ=255) tttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattg < 1:7317932‑M1/101‑50 (MQ=255) tttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattg < 1:10280975‑M1/101‑50 (MQ=255) tttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattg < 1:7029713‑M1/101‑50 (MQ=255) tttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattg < 1:6588181‑M1/101‑50 (MQ=255) tttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattg < 1:9581879‑M1/101‑50 (MQ=255) ccACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaa < 1:3597312‑M1/101‑55 (MQ=255) cacaTCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaat > 1:8458757‑M1/1‑46 (MQ=255) catcatAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaatta > 1:6299473‑M1/1‑44 (MQ=255) catAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattg < 1:6401038‑M1/101‑61 (MQ=255) atAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgt < 1:2851389‑M1/101‑62 (MQ=255) aaTCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgc < 1:6756901‑M1/101‑64 (MQ=255) tCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcat < 1:5456070‑M1/101‑66 (MQ=255) tGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttc < 1:4556736‑M1/101‑69 (MQ=255) cTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcacta < 1:11833592‑M1/101‑73 (MQ=255) cTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgccgttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcacta < 1:10074886‑M1/101‑73 (MQ=255) tGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactact < 1:11682287‑M1/101‑75 (MQ=255) tGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactact < 1:3781772‑M1/101‑75 (MQ=255) gCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg > 1:3321692‑M1/1‑26 (MQ=255) tGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactgga < 1:4943063‑M1/101‑78 (MQ=255) gaagaaTAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa > 1:7652245‑M1/1‑23 (MQ=255) gaagaaTAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa > 1:11794352‑M1/1‑23 (MQ=255) gaagaaTAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa < 1:11436479‑M1/101‑79 (MQ=255) gaagaaTAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa > 1:10730433‑M1/1‑23 (MQ=255) gaagaaTAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttgctagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattatgcatttcactactggaa < 1:8524955‑M1/101‑79 (MQ=255) aagaaTAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaac > 1:10263136‑M1/1‑22 (MQ=255) aagaaTAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaac < 1:10614772‑M1/101‑80 (MQ=255) agaaTAATTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaact < 1:1822315‑M1/101‑81 (MQ=255) tgcctgcaaaTGATTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCC‑‑ACAAACACAATAACTTAAATAAGTGATATACTTAATACTAGTTTTTAGACTCGTCACTGgag > 1:9198387/8‑101 (MQ=0) ataatTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgta < 1:1505190‑M1/101‑84 (MQ=255) ataatTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgta > 1:5013086‑M1/1‑18 (MQ=255) taatTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaa < 1:7870891‑M1/101‑85 (MQ=255) taatTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaa < 1:11143941‑M1/101‑85 (MQ=255) taatTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaa > 1:1651267‑M1/1‑17 (MQ=255) taatTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaa > 1:9515048‑M1/1‑17 (MQ=255) atTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatc < 1:7848683‑M1/101‑87 (MQ=255) atTGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatc > 1:8589986‑M1/1‑15 (MQ=255) tGAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcag < 1:869673‑M1/101‑89 (MQ=255) gAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcaga > 1:645005‑M1/1‑12 (MQ=255) gAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcaga > 1:9035187‑M1/1‑12 (MQ=255) gAAATGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcaga > 1:7574801‑M1/1‑12 (MQ=255) aaaTGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaa > 1:10834662‑M1/1‑11 (MQ=255) aTGA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaa > 1:9391484‑M1/1‑9 (MQ=255) gA‑TATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaaga > 1:1415996‑M1/1‑7 (MQ=255) tattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagata > 1:3419622‑M1/1‑5 (MQ=255) tattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagata < 1:1042728‑M1/101‑97 (MQ=255) attaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagaca < 1:11233674‑M1/101‑101 (MQ=255) | AGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGA‑TATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGT > NC_007779/1300940‑1301140 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |