| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_007779 | 1,301,041 | Δ1,336 bp | 100% | insC–insD | insC, insD | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_007779 | 1301041–1302367 | 1302376 | 10–1336 | 227 [1] | [0] 226 | insC–insD | insC, insD |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 1301040 | 1 (0.000) | 184 (0.850) | 104/166 | NT | 99.8% | intergenic (+218/‑90) | ychE/insC | inner membrane protein/IS2 element protein |
| ? | NC_007779 | 1302377 = | 0 (0.000) | intergenic (+19/‑519) | insD/oppA | IS2 element protein/oligopeptide transporter subunit | |||||
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
GCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACAT > NC_007779/1302277‑1302477 | gttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattat < 1:3285754‑M2/1‑1 (MQ=255)gttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattat < 1:9313947‑M2/1‑1 (MQ=255)gttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattat > 1:8300304‑M2/101‑101 (MQ=255) ttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattatt < 1:5585192‑M2/2‑1 (MQ=255) tagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattatta < 1:10950490‑M2/3‑1 (MQ=255) ttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAAtt < 1:4023132‑M2/6‑1 (MQ=255) ttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAAtt < 1:7095833‑M2/6‑1 (MQ=255) ataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTcc < 1:1531187‑M2/8‑1 (MQ=255) ataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTcc > 1:7275242‑M2/94‑101 (MQ=255) taaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCa < 1:1913736‑M2/9‑1 (MQ=255) aaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCAc < 1:4837976‑M2/10‑1 (MQ=255) aaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCAc > 1:1604033‑M2/92‑101 (MQ=255) aggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACt < 1:3588990‑M2/11‑1 (MQ=255) gatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGc > 1:11283458‑M2/89‑101 (MQ=255) tccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCttt > 1:8452122‑M2/85‑101 (MQ=255) tccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCttt < 1:8808031‑M2/17‑1 (MQ=255) tccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCttt > 1:4633700‑M2/85‑101 (MQ=255) ccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTg > 1:1878317‑M2/84‑101 (MQ=255) cttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTgg > 1:10578369‑M2/83‑101 (MQ=255) cttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTgg < 1:6202413‑M2/19‑1 (MQ=255) ttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGt < 1:8561773‑M2/20‑1 (MQ=255) ttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGt > 1:1024159‑M2/82‑101 (MQ=255) taactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTa > 1:1688872‑M2/81‑101 (MQ=255) taactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTa > 1:25468‑M2/81‑101 (MQ=255) aactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTag > 1:10013804‑M2/80‑101 (MQ=255) ctgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTagag > 1:6166313‑M2/78‑101 (MQ=255) tgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAgg < 1:10800261‑M2/25‑1 (MQ=255) gcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGa < 1:8651901‑M2/26‑1 (MQ=255) tctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAg < 1:5503418‑M2/29‑1 (MQ=255) tctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAg > 1:8996568‑M2/73‑101 (MQ=255) tctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAg > 1:3040501‑M2/73‑101 (MQ=255) tctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAg < 1:2844854‑M2/29‑1 (MQ=255) tcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTg > 1:6790920‑M2/71‑101 (MQ=255) tcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTg < 1:7992840‑M2/31‑1 (MQ=255) ctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCt > 1:2923823‑M2/69‑101 (MQ=255) tcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTa < 1:5344540‑M2/34‑1 (MQ=255) tcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTa < 1:10084590‑M2/34‑1 (MQ=255) tcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTa > 1:219845‑M2/68‑101 (MQ=255) caccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGACAGTGCTaa < 1:4333149‑M2/35‑1 (MQ=255) caccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTaa < 1:9692419‑M2/35‑1 (MQ=255) accatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTaaa < 1:1048603‑M2/36‑1 (MQ=255) accatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTaaa < 1:551696‑M2/36‑1 (MQ=255) accatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTaaa > 1:8026502‑M2/66‑101 (MQ=255) ccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAaat < 1:1159332‑M2/37‑1 (MQ=255) catcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAaata > 1:8612547‑M2/64‑101 (MQ=255) atcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAaataa > 1:6965053‑M2/63‑101 (MQ=255) atcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAaataa > 1:6466708‑M2/63‑101 (MQ=255) atgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAaataataa > 1:744876‑M2/60‑101 (MQ=255) atgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAaataataa < 1:3438279‑M2/42‑1 (MQ=255) atgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAaataataa > 1:11527646‑M2/60‑101 (MQ=255) atgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAaataataa < 1:3632025‑M2/42‑1 (MQ=255) gttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATc > 1:11865224‑M2/58‑101 (MQ=255) ttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCa > 1:7571509‑M2/57‑101 (MQ=255) attttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAAt < 1:5005787‑M2/47‑1 (MQ=255) attttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAAt > 1:10669535‑M2/55‑101 (MQ=255) tttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTg < 1:11814572‑M2/49‑1 (MQ=255) tttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTg < 1:9581879‑M2/49‑1 (MQ=255) tttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTg < 1:10280975‑M2/49‑1 (MQ=255) catcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAatta > 1:6299473‑M2/45‑101 (MQ=255) cataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATtg < 1:6401038‑M2/60‑1 (MQ=255) taatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg < 1:786686‑M2/62‑1 (MQ=255) taatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg < 1:5890876‑M2/62‑1 (MQ=255) aatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGc > 1:6358468‑M2/39‑101 (MQ=255) cctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAtt < 1:8477226‑M2/66‑1 (MQ=255) ctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt > 1:180559‑M2/35‑101 (MQ=255) tgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc < 1:4556736‑M2/68‑1 (MQ=255) tgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc < 1:11018835‑M2/68‑1 (MQ=255) gggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa > 1:1143453‑M2/33‑101 (MQ=255) gggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa < 1:3492211‑M2/69‑1 (MQ=255) cttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCGTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCacta < 1:10074886‑M2/72‑1 (MQ=255) tgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact < 1:3781772‑M2/74‑1 (MQ=255) tgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact < 1:11682287‑M2/74‑1 (MQ=255) tgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGa < 1:2160822‑M2/77‑1 (MQ=255) tgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGa < 1:4943063‑M2/77‑1 (MQ=255) gaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGaa > 1:6690883‑M2/24‑101 (MQ=255) gaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGaa > 1:10730433‑M2/24‑101 (MQ=255) aagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAAc > 1:10263136‑M2/23‑101 (MQ=255) aagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAAc < 1:10614772‑M2/79‑1 (MQ=255) aagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAAc > 1:7619243‑M2/23‑101 (MQ=255) agaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt > 1:3130606‑M2/22‑101 (MQ=255) agaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt < 1:7670428‑M2/80‑1 (MQ=255) ataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTa > 1:1434453‑M2/19‑101 (MQ=255) taattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTaa < 1:11143941‑M2/84‑1 (MQ=255) taattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTaa > 1:9515048‑M2/18‑101 (MQ=255) attgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATc < 1:7848683‑M2/86‑1 (MQ=255) ttgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCa > 1:7212867‑M2/15‑101 (MQ=255) tgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAg > 1:5290257‑M2/14‑101 (MQ=255) gaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGa < 1:11703547‑M2/89‑1 (MQ=255) gaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGa > 1:645005‑M2/13‑101 (MQ=255) aaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGaa > 1:10834662‑M2/12‑101 (MQ=255) aatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGaaa > 1:9151995‑M2/11‑101 (MQ=255) atgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGaaaa > 1:9391484‑M2/10‑101 (MQ=255) gatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGa < 1:1946072‑M2/94‑1 (MQ=255) tattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGTACTGTAATCAGAAAAGCTa < 1:8431017‑M2/96‑1 (MQ=255) tattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATa < 1:1042728‑M2/96‑1 (MQ=255) tattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATa > 1:3419622‑M2/6‑101 (MQ=255) tattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATa < 1:1617617‑M2/96‑1 (MQ=255) ttaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGa > 1:4211593‑M2/4‑101 (MQ=255) aTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACa < 1:6725306‑M2/100‑1 (MQ=255) aTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACa < 1:11233674‑M2/100‑1 (MQ=255) | GCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACAT > NC_007779/1302277‑1302477 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |